MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Klebsiella pneumoniae JM45 plasmid p2

Total Repeats: 245

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022083	TA	4	8	1	8	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022083	CTC	2	6	30	35	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_022083	AT	3	6	52	57	50 %	50 %	0 %	0 %	530633266
4	NC_022083	A	6	6	83	88	100 %	0 %	0 %	0 %	530633266
5	NC_022083	GCC	2	6	98	103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530633266
6	NC_022083	CAA	2	6	143	148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530633266
7	NC_022083	TAT	2	6	153	158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530633266
8	NC_022083	TCA	2	6	168	173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530633266
9	NC_022083	ACTT	2	8	175	182	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_022083	GAG	2	6	221	226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022083	CCA	2	6	272	277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_022083	GAA	2	6	288	293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022083	AAG	2	6	401	406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022083	CCG	2	6	430	435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_022083	GGC	2	6	483	488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_022083	GGC	2	6	557	562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530633267
17	NC_022083	TCA	2	6	696	701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530633267
18	NC_022083	GCC	2	6	755	760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530633267
19	NC_022083	CAC	2	6	771	776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530633267
20	NC_022083	TTTA	2	8	946	953	25 %	75 %	0 %	0 %	530633267
21	NC_022083	AGG	2	6	1024	1029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530633267
22	NC_022083	ATAA	2	8	1076	1083	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022083	A	6	6	1118	1123	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022083	TAC	2	6	1157	1162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_022083	GCA	2	6	1168	1173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_022083	TTG	2	6	1202	1207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022083	ATC	2	6	1318	1323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_022083	CA	3	6	1356	1361	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_022083	T	6	6	1366	1371	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022083	CGG	2	6	1579	1584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_022083	CAA	2	6	1602	1607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_022083	CCG	2	6	1621	1626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_022083	ATGC	2	8	1654	1661	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_022083	GCATA	2	10	1676	1685	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_022083	T	7	7	1717	1723	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022083	TCA	2	6	1738	1743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_022083	CTGA	2	8	1746	1753	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_022083	CTT	2	6	1789	1794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530633268
39	NC_022083	AC	3	6	1839	1844	50 %	0 %	0 %	50 %	530633268
40	NC_022083	GTT	2	6	1925	1930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530633268
41	NC_022083	GAA	2	6	1947	1952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530633268
42	NC_022083	CCG	2	6	1996	2001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530633268
43	NC_022083	AAC	2	6	2035	2040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530633268
44	NC_022083	ATG	2	6	2087	2092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530633269
45	NC_022083	TGGAA	2	10	2093	2102	40 %	20 %	40 %	0 %	530633269
46	NC_022083	GCG	2	6	2200	2205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530633269
47	NC_022083	ATG	2	6	2300	2305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530633269
48	NC_022083	TGA	2	6	2307	2312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530633269
49	NC_022083	CCA	2	6	2459	2464	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530633270
50	NC_022083	CCGG	2	8	2478	2485	0 %	0 %	50 %	50 %	530633270
51	NC_022083	CTG	2	6	2491	2496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530633270
52	NC_022083	CAG	2	6	2513	2518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530633270
53	NC_022083	CCT	2	6	2554	2559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530633270
54	NC_022083	T	6	6	2602	2607	0 %	100 %	0 %	0 %	530633270
55	NC_022083	CCA	2	6	2695	2700	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530633270
56	NC_022083	ACC	2	6	2705	2710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530633270
57	NC_022083	GGAA	2	8	2873	2880	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022083	A	6	6	2900	2905	100 %	0 %	0 %	0 %	530633271
59	NC_022083	GCT	2	6	2943	2948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530633271
60	NC_022083	TGGATA	2	12	2972	2983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530633271
61	NC_022083	GGA	2	6	3057	3062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530633271
62	NC_022083	T	6	6	3097	3102	0 %	100 %	0 %	0 %	530633272
63	NC_022083	CCA	2	6	3112	3117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530633272
64	NC_022083	CGG	2	6	3119	3124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530633272
65	NC_022083	TCC	2	6	3134	3139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530633272
66	NC_022083	CGCT	2	8	3233	3240	0 %	25 %	25 %	50 %	530633272
67	NC_022083	ACC	2	6	3242	3247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530633272
68	NC_022083	ATC	2	6	3251	3256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530633272
69	NC_022083	ACC	2	6	3293	3298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530633272
70	NC_022083	CA	3	6	3348	3353	50 %	0 %	0 %	50 %	530633272
71	NC_022083	TCG	2	6	3422	3427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530633272
72	NC_022083	TCA	2	6	3462	3467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530633272
73	NC_022083	CAC	2	6	3529	3534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530633272
74	NC_022083	ATG	2	6	3563	3568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530633272
75	NC_022083	TCC	2	6	3587	3592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530633272
76	NC_022083	AATA	2	8	3601	3608	75 %	25 %	0 %	0 %	530633272
77	NC_022083	CCG	2	6	3684	3689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530633273
78	NC_022083	CGG	2	6	3812	3817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530633273
79	NC_022083	ACC	2	6	3836	3841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530633273
80	NC_022083	C	6	6	3975	3980	0 %	0 %	0 %	100 %	530633273
81	NC_022083	GCC	2	6	4034	4039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530633273
82	NC_022083	AAT	2	6	4063	4068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530633273
83	NC_022083	CTCGTC	2	12	4081	4092	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	530633273
84	NC_022083	GCG	2	6	4113	4118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530633273
85	NC_022083	CAG	2	6	4171	4176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530633273
86	NC_022083	CCA	2	6	4185	4190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530633273
87	NC_022083	CCG	2	6	4221	4226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530633273
88	NC_022083	CCG	2	6	4254	4259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530633273
89	NC_022083	CAGC	2	8	4279	4286	25 %	0 %	25 %	50 %	530633273
90	NC_022083	ATC	3	9	4380	4388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530633274
91	NC_022083	GCT	2	6	4397	4402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530633274
92	NC_022083	GCT	2	6	4497	4502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530633274
93	NC_022083	TCA	2	6	4532	4537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530633274
94	NC_022083	CCT	2	6	4592	4597	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530633274
95	NC_022083	CGC	2	6	4613	4618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530633274
96	NC_022083	CGG	2	6	4654	4659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530633274
97	NC_022083	CGC	2	6	4695	4700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530633274
98	NC_022083	CTGG	2	8	4716	4723	0 %	25 %	50 %	25 %	530633274
99	NC_022083	CG	3	6	4725	4730	0 %	0 %	50 %	50 %	530633274
100	NC_022083	AGC	2	6	4834	4839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530633274
101	NC_022083	CAG	2	6	4893	4898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530633274
102	NC_022083	ATG	2	6	4918	4923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530633274
103	NC_022083	ATG	2	6	4960	4965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530633274
104	NC_022083	GC	3	6	4970	4975	0 %	0 %	50 %	50 %	530633274
105	NC_022083	ACA	2	6	4985	4990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530633274
106	NC_022083	TCT	2	6	4991	4996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530633274
107	NC_022083	GCC	3	9	5046	5054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530633274
108	NC_022083	GCC	3	9	5176	5184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530633274
109	NC_022083	CTG	2	6	5190	5195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530633274
110	NC_022083	CGC	2	6	5235	5240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530633274
111	NC_022083	CAG	2	6	5307	5312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530633274
112	NC_022083	TTC	2	6	5314	5319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530633274
113	NC_022083	CAG	2	6	5382	5387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530633274
114	NC_022083	ACC	2	6	5455	5460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530633274
115	NC_022083	TGG	2	6	5498	5503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530633274
116	NC_022083	CTG	2	6	5619	5624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530633274
117	NC_022083	GCTG	2	8	5720	5727	0 %	25 %	50 %	25 %	530633274
118	NC_022083	AGC	2	6	5794	5799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530633274
119	NC_022083	CAG	2	6	5808	5813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530633274
120	NC_022083	GCCC	2	8	5840	5847	0 %	0 %	25 %	75 %	530633274
121	NC_022083	GCA	2	6	5882	5887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530633274
122	NC_022083	TAA	2	6	5890	5895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530633274
123	NC_022083	ACA	2	6	5959	5964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530633274
124	NC_022083	C	7	7	5967	5973	0 %	0 %	0 %	100 %	530633274
125	NC_022083	GCC	2	6	6026	6031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530633274
126	NC_022083	TTA	2	6	6094	6099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530633274
127	NC_022083	CGC	2	6	6127	6132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530633274
128	NC_022083	TCCG	2	8	6161	6168	0 %	25 %	25 %	50 %	530633274
129	NC_022083	CAGC	2	8	6243	6250	25 %	0 %	25 %	50 %	530633274
130	NC_022083	TC	4	8	6328	6335	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_022083	GAC	2	6	6341	6346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_022083	CTG	2	6	6373	6378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_022083	GGC	3	9	6407	6415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530633275
134	NC_022083	GTG	2	6	6426	6431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530633275
135	NC_022083	GGA	2	6	6497	6502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530633275
136	NC_022083	GGC	2	6	6536	6541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_022083	AGCG	2	8	6592	6599	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
138	NC_022083	ACC	2	6	6604	6609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_022083	AGC	2	6	6622	6627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_022083	TGC	2	6	6630	6635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_022083	GGT	2	6	6671	6676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530633276
142	NC_022083	CCAG	2	8	6776	6783	25 %	0 %	25 %	50 %	530633276
143	NC_022083	A	6	6	6855	6860	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_022083	CCT	2	6	7018	7023	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
145	NC_022083	GCG	2	6	7059	7064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_022083	CCT	2	6	7176	7181	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
147	NC_022083	CA	3	6	7401	7406	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_022083	CTG	2	6	7479	7484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_022083	GCA	2	6	7545	7550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_022083	ACC	2	6	7721	7726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
151	NC_022083	GGT	2	6	7733	7738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
152	NC_022083	T	6	6	7738	7743	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_022083	A	7	7	7772	7778	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_022083	AAG	2	6	7786	7791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
155	NC_022083	AGG	2	6	7836	7841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530633277
156	NC_022083	AGA	2	6	7901	7906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530633277
157	NC_022083	A	7	7	7913	7919	100 %	0 %	0 %	0 %	530633277
158	NC_022083	ACCTTT	2	12	7940	7951	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	530633277
159	NC_022083	ATC	2	6	8020	8025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_022083	T	6	6	8034	8039	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_022083	ATTTT	2	10	8099	8108	20 %	80 %	0 %	0 %	530633278
162	NC_022083	CAA	2	6	8122	8127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530633278
163	NC_022083	CAT	2	6	8211	8216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
164	NC_022083	CTC	2	6	8236	8241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
165	NC_022083	TCT	2	6	8259	8264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
166	NC_022083	ATTTA	2	10	8281	8290	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_022083	T	6	6	8317	8322	0 %	100 %	0 %	0 %	530633279
168	NC_022083	ACC	4	12	8488	8499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530633279
169	NC_022083	T	7	7	8511	8517	0 %	100 %	0 %	0 %	530633279
170	NC_022083	T	7	7	8524	8530	0 %	100 %	0 %	0 %	530633279
171	NC_022083	TTC	2	6	8551	8556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530633279
172	NC_022083	GAT	2	6	8571	8576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530633279
173	NC_022083	T	6	6	8653	8658	0 %	100 %	0 %	0 %	530633279
174	NC_022083	ATTC	2	8	8718	8725	25 %	50 %	0 %	25 %	530633279
175	NC_022083	ATTCTG	2	12	8764	8775	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	530633279
176	NC_022083	ATC	2	6	8851	8856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530633279
177	NC_022083	TGCCTC	2	12	8863	8874	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	530633279
178	NC_022083	CAG	2	6	8901	8906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530633279
179	NC_022083	CAGCT	2	10	8983	8992	20 %	20 %	20 %	40 %	530633279
180	NC_022083	GCG	2	6	9035	9040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530633279
181	NC_022083	CTG	2	6	9049	9054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530633279
182	NC_022083	TCC	2	6	9068	9073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530633279
183	NC_022083	CTGTC	2	10	9133	9142	0 %	40 %	20 %	40 %	530633279
184	NC_022083	ACC	2	6	9178	9183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530633279
185	NC_022083	CAA	2	6	9222	9227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530633279
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187	NC_022083	CCA	2	6	9342	9347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530633279
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194	NC_022083	CGG	2	6	9624	9629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530633279
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198	NC_022083	ACC	2	6	9772	9777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530633279
199	NC_022083	CCG	2	6	9788	9793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530633279
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201	NC_022083	GCCCG	2	10	9856	9865	0 %	0 %	40 %	60 %	530633279
202	NC_022083	ACC	3	9	9880	9888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530633279
203	NC_022083	TGA	2	6	9889	9894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530633279
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205	NC_022083	CCA	2	6	9986	9991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530633279
206	NC_022083	C	6	6	10072	10077	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
207	NC_022083	GAA	2	6	10160	10165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530633280
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212	NC_022083	CGG	2	6	10438	10443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530633280
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220	NC_022083	TCC	2	6	11134	11139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530633280
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229	NC_022083	GTT	2	6	11529	11534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530633280
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232	NC_022083	CTC	2	6	11598	11603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
233	NC_022083	CCG	2	6	11705	11710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
234	NC_022083	ATG	2	6	11742	11747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
235	NC_022083	TGGC	2	8	11810	11817	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
236	NC_022083	TA	4	8	11957	11964	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
237	NC_022083	CTC	2	6	11986	11991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
238	NC_022083	AT	3	6	12008	12013	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
239	NC_022083	A	6	6	12039	12044	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
240	NC_022083	GCC	2	6	12054	12059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
241	NC_022083	CAA	2	6	12099	12104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
242	NC_022083	TAT	2	6	12109	12114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
243	NC_022083	TCA	2	6	12124	12129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
244	NC_022083	ACTT	2	8	12131	12138	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
245	NC_022083	GAG	2	6	12177	12182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.